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近日消息，科技资讯平台发布了一篇博文，详细报道了谷歌公司在生物技术和制药科学领域的一项重大进展。据悉，谷歌已成功获批一项新专利，该专利涉及一种基于全原子表征扩散模型的尖端蛋白质设计系统，这一系统实现了前所未有的精度和效率，有望为相关领域带来革命性的突破。
该专利编号为 WO2024240774A1，全称名为《在全原子表征上运行的蛋白质设计扩散模型》（PROTEIN DESIGN USING DIFFUSION MODELS OPERATING ON FULL ATOM REPRESENTATIONS）。
根据 DeepMind 的专利描述，该系统突破性地整合了先进神经网络和基于扩散的方法，实现了原子级蛋白质设计，相比传统方法分步进行结构预测和序列优化，新系统将两者统一到单次前向传递中，简化流程，提升效率。
该系统的核心是全原子表征管理，主要采用“抛弃式空间位置”（throw-away spatial positions）巧妙管理原子级数据，精准控制每个蛋白质残基内的原子，避免了传统相位机制的复杂性。
该系统的另一项创新，是统一了结构-序列预测，在单次前向传递中整合结构和序列预测，显著提升计算效率和简化实施流程。
此外，该系统结合基于目标分子结构信息的条件去噪过程，实现具有特定功能和结合特性的蛋白质定制化设计方案。
整套系统由扩散模型系统、原子控制框架和集成系统三部分组成，整个运作机制如下：
第一阶段为生成含噪声分子数据，结合目标分子信息，并用临时位置初始化未使用的原子数据空间位置。
第二阶段去噪过程开始，通过迭代优化逐步降低噪声并动态优化原子位置，整合结构-序列预测，减少计算冗余。
最后，生成优化后的高精度蛋白质结构，验证序列准确性，并进行质量检查，确保最终设计的结构稳定性。
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